این بخش دارای ۲ نفر هیات علمی و ۱۴ نیروی پرستاری و ۴ نیروی کمک پرستاری می باشد. پزشکان این بخش از سال ۱۳۸۵ در دانشگاه علوم پزشکی تهران فعالیت داشته‌اند.
بخش پیوند سلول‌های بنیادی خونساز این بیمارستان به عنوان پیشرفته‌ترین بخش پیوند سلول‌های بنیادی در رده سنی کودکان و نوجوانان، با ظرفیت کامل ۹ تخت خدمات مدرن پیوند سلول‌های بنیادی را به بیماران نیازمند به پیوند از سن دوماهگی تا ۱۸ سالگی ارائه می‌دهد.
در حال حاضر پیوندهای پیشرفته و به روز دنیا در این بخش جهت درمان بیماری‌های صعب العلاج نظیر بدخیمی های خونی (انواع لوسمی ها) بیماری‌های غیر بدخیم خونی (تالاسمی ماژور، انمی اپلاستیک، انمی فانکونی و …) نقایص ایمنی ارثی (CGD, LAD, SCID و …) بیماری‌های متابولیک (استئوپروز، موکوپلی ساکاریدوز، نیمن پیک و …) تومورهای جامد کودکان (نوروبلاستوم، سارکوم یوئینگ، تومور ویلمز، رابدمیوسارکوم و …) انجام می‌شود. از جمله انواع این پیوندها می‌توان به پیوند از اهداکنندگان غیر خویشاوند، پیوند بند ناف (cord blood) و پیوند نیمه سازگار(haploidentical) اشاره کرد.
